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Construction of Pseudoalteromonas - Escherichia coli shuttle vector based on a small plasmid from the marine organism Pseudoalteromonas

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Title
Construction of Pseudoalteromonas - Escherichia coli shuttle vector based on a small plasmid from the marine organism Pseudoalteromonas
Other Titles
극지해양 Pseudoalteromonas 유래의 소형 플라스미드에 기반한 Pseudoalteromonas - Escherichia coli 셔틀벡터 제작
Authors
Kim, Dockyu
Park, Hyun
Park, Ha Ju
Keywords
Pseudoalteromonas; cold-active enzyme; gene transfer; shuttle vector
Issue Date
2016
Citation
Kim, Dockyu, Park, Hyun, Park, Ha Ju. 2016. "Construction of Pseudoalteromonas - Escherichia coli shuttle vector based on a small plasmid from the marine organism Pseudoalteromonas". Journal of microbiology, 52(1): 110-115.
Abstract
남극 해양세균 Pseudoalteromonas sp. PAMC 21150에서 분리한 소형 플라스미드(small plasmid, pDK4)의 크기는 3,480 bp이고 G+C 함량은 41.64%이며, 3개의 open reading frames (ORFs)을 포함하고 있다. 3개의 ORF는 replication initiation protein (RepA), conjugative mobilization protein (Mob), 그리고 기능이 밝혀지지 않은 단백질을 코팅하고 있다. PCR 반응으로 증폭한 pDK4를 Escherichia coli high-copy pUC19 클로닝 벡터에 삽입하여 fusion vector (pDOC153)를 제작하였고, pDOC153에 chloramphenicol 저항성 유전자를 삽입하여 ampicillin/chloramphenicol 저항성 Pseudoalteromonas - Escherichia coli 셔틀 벡터(shuttle vector;7,216 bp 크기;pDOC155)를 제작하였다. 북극 해양세균 P. issachenkonii PAMC 22718이 보유한 2개의 유전자(TonB-dependent receptor gene, chi22718_IV, and exochitinase gene, chi22718_III)를 pDOC155에 삽입하여 두 개의 pDOC155 변형체(pDOC158, pDOC165)를 제작하였다. pDOC158 혹은 pDOC165을 이용하여 triparental mating 방법에 의해 플리스미드 미보유 해양세균인 Pseudoalteromonas sp. PAMC 22137를 형질전환하였다. PCR을 이용한 유전자 증폭실험을 통해서, pDOC158와 pDOC165에 삽입된 유전자들은 Pseudoalteromonas sp. PAMC 22137와 E. coli DH5α 내에서 안정적으로 유지되는 것을 확인하였다. 위의 결과는 셔틀 벡터 pDOC155는 Pseudoalteromonas spp. 유래 유전자들을 다른 Pseudoalteromonas spp. 세포 안으로 전달할 수 있는 새로운 유전자 전달시스템으로 이용될 수 있음을 보여주었다.
URI
http://repository.kopri.re.kr/handle/201206/7444
DOI
http://dx.doi.org/10.7845/kjm.2016.5054
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